PDC Center for High Performance Computing

Requesting new software

If you want to use software that is not currently installed, then you should contact PDC support.

Overview

Sort by: Alphabet, Category

Systems: All, Beskow, Tegner, Milner

Applications

Bioinformatics

Program System Available versions
allpaths-lg Tegner 52488
blast Tegner 2.2.17
bwa Tegner 0.7.12
canu Tegner 1.3, 1.0
cdo Beskow 1.6.7
daligner Tegner 1.0
dazz_db Tegner mk-flow-1
falcon Tegner 0.2jasm
freebayes Tegner apr.2016
hipmer Beskow 0.9.4
idba Tegner 1.1.2, 1.0.9
megahit Tegner 1.0.3
memsat-svm Tegner 1
phylobayes Beskow 1.7a, 1.5a
Tegner 1.7a, 1.5a
ray Beskow 2.3.1
Tegner 2.3.1
samtools Tegner 0.1.19
SPAdes Tegner 3.8.1, 3.7.1, 3.5.0
thumbup Tegner 0
tophat Tegner 2.1.0

Chemistry

Program System Available versions
ABINIT Beskow 7.10.2
ase Beskow 3.10.0, 3.8.1
Tegner 3.10.0
cp2k Beskow 3.0-libxc-plumed, 3.0, 2.6.2, 2.5.1
Dalton Beskow 2013.4
DIRAC Beskow 14.0
gamess Beskow 2013-05-01-R1
Gaussian Tegner g09.D01
gpaw Beskow 1.0.0, 0.10.0
libxc Beskow 2.0.1
NWChem Beskow 6.5
Quantum-ESPRESSO Beskow 5.2.1+west-1.0.2, 5.1.1
siesta Beskow trunk-462, 3.2-pl-5
VASP Beskow 5.4.1.patched, 5.3.5-vtst3.1, 5.3.5-31Mar14
Tegner 5.4.1, 5.3.5
Yambo Beskow 4.0.2

Molecular Dynamics

Program System Available versions
almost Beskow 2.1.0, 2.1
Amber Beskow 14, 12
Tegner 14
GROMACS Beskow 5.1.2, 5.1.1, 5.1, 5.0.6, 5.0.4, 4.6.7
Tegner 5.1.2, 5.0.6, 4.6.7
LAMMPS Beskow 30Oct14, 10Feb15, 10Aug15
NAMD Beskow 2.10
plumed Beskow 2.2.1, 2.1.2, 2.1.1

Other Applications

Program System Available versions
Abaqus Tegner 6.14, 6.13, 6.12
Caffe Tegner git-c6d93da
CFITSIO Tegner 3.390
dock Beskow 6.7, 3.7
Elmerice Beskow 5148096_06-17-15-gnu
gensys Tegner 1510
KyotoCabinet Tegner 1.2.76
latex Tegner 20150811
mumax3 Tegner 3.9.1c
papi Tegner 5.4.3
pigz Tegner 2.3.3
ROOT Tegner 6.06.00, 5.34.34
Comsol Tegner 5.2a, 5.2, 5.1.0.180, 5.1, 5.0
dssp Beskow 2.2.1
Tegner 2.2.1
Elmer Beskow trunk_e0d5e66_gnu
Tegner a450ffc-gnu
FDTD Tegner 8.15
geant4 Tegner 10.2, 9.5p01
gribex Beskow 000370
MicroMagnum Tegner 0.2rc4
oommf Tegner 1.2alpha
pflotran Tegner 2014.07.15
pencilcode Beskow r18525
Torch Tegner git-7fc533e

Tools

Mathematic

Program System Available versions
gams Tegner 24.7.1, 24.2.2, 23.7.3
mathematica Tegner 10.2.0
matlab Tegner r2015a, r2014b
MultiNest Tegner 3.10-gcc-4.8-openmpi-1.8, 3.10-cmake
R Beskow 3.1.2
Tegner 3.3.1, 3.2.0
Milner 3.2.2
sage Tegner 7.0

Visualization

Program System Available versions
blender Tegner 2.77a
gnuplot Beskow 5.0.0, 4.6.6
grace Beskow 5.1.23
Paraview Tegner 5.0.0, 4.3.1, 3.8.1
VisIt Tegner 2.10.0, 2.9.2, 2.8.2
vmd Tegner 1.9.2, 1.9.1

Other Tools

Program System Available versions
allinea-reports Beskow 6.0
cdo Beskow 1.6.7
CMake Beskow 3.0.2, 2.8.12.2
Tegner 3.5.1, 3.1.3, 2.8.8
Milner 3.6.0
DDT Beskow 4.2.2
Tegner 7.0, 5.0.1-43113
extrae Beskow 3.2.1.gnu, 3.2.1.cray
grib_api Beskow 1.12.1-intel, 1.12.1-cray
mercurial Beskow 3.2.2
Tegner 3.4.2
mono Beskow 3.12.0
Tegner 3.12.1
nano Beskow 2.3.6
scons Beskow 2.3.4
tcl Tegner 8.6.4

Compilers and Languages

Program System Available versions
cray Beskow 8.3.4
Milner 8.2.3
gcc Beskow 4.9.1
Tegner 5.3.0, 5.1, 4.9.2, 4.8.4
intel Beskow 15.0.1, 14.0.4
Tegner 15.0.2
perl Tegner 5.16
pgi Tegner 15.1
python Beskow 2.7.8, 2.6.9
Tegner 3.4.2, 2.7.9, 2.7.6, 2.7.5
upcc Beskow 2.22.0

Libraries

Program System Available versions
boost Beskow 1.57.0
Tegner 1.59.0, 1.58.0
Milner 1.61.0
cgns Beskow 3.2.1
Tegner 3.2-1-intel-15.0, 3.2-1-gcc-4.9, 3.2-1-gcc-4.8
cray-hdf5 Beskow 1.8.14, 1.8.13
cray-libsci Beskow 13.0.1
cray-petsc Beskow 3.5.2.1, 3.5.2.0, 3.5.1.0, 3.4.4.0
fftw Beskow 3.3.4.1, 3.3.4.0, 2.1.5.7
Tegner 3.3.4
freesteam Beskow 2.0
Tegner 2.0-gcc-4.8
GLPK Tegner 4.50
gmp Tegner 6.1.0
gsl Beskow 1.16
Tegner 1.16
hdf5 Beskow 1.8.14
Tegner 1.8.12
intelmpi Tegner 5.0.3
mkl Tegner 15.0.2
mpc Tegner 1.0.3
mpfr Tegner 3.1.4
openmpi Tegner 1.10-gcc-java, 1.10-gcc-5.1, 1.8-gcc-5.1, 1.8-gcc-4.9, 1.8-gcc-4.8
petsc Tegner 3.6.1-real, 3.6.1-complex, 3.6.1, 3.5.4-complex
slepc Tegner 3.6.0-real, 3.6.0-complex

Uncategorized

Program System Available versions
matconvnet Tegner 1.0