PDC Center for High Performance Computing

Requesting new software

If you want to use software that is not currently installed, then you should contact PDC support.

Overview

Sort by: Alphabet, Category

Systems: All, Beskow, Tegner, Milner

Applications

Bioinformatics

Program System Available versions
allpaths-lg Tegner 52488
blast Tegner 2.2.17
bwa Tegner 0.7.12
canu Tegner 1.3, 1.0
daligner Tegner 1.0
dazz_db Tegner mk-flow-1
falcon Tegner 0.2jasm
freebayes Tegner apr.2016
idba Tegner 1.1.2, 1.0.9
IQ-TREE Beskow 1.4.4
Tegner 1.4.4
megahit Tegner 1.0.3
memsat-svm Tegner 1
phylobayes Beskow 1.7a, 1.5a
Tegner 1.7a, 1.5a
ray Beskow 2.3.1
Tegner 2.3.1
samtools Tegner 0.1.19
SPAdes Tegner 3.8.1, 3.7.1, 3.5.0
thumbup Tegner 0
tophat Tegner 2.1.0

Chemistry

Program System Available versions
ABINIT Beskow 7.10.5, 7.10.2
ase Beskow 3.10.0, 3.8.1
Tegner 3.10.0
cp2k Beskow 3.0-libxc-plumed, 3.0, 2.6.2, 2.5.1
Dalton Beskow 2013.4
DIRAC Beskow 14.0
gamess Beskow 2013-05-01-R1, 2012-05-01-R1
Gaussian Tegner g09.D01
gpaw Beskow 1.0.0, 0.10.0
libxc Beskow 2.0.1
NWChem Beskow 6.5
Quantum-ESPRESSO Beskow 6.0, 5.2.1+west-1.0.2, 5.1.1
siesta Beskow trunk-462, 3.2-pl-5
VASP Beskow 5.4.1.patched, 5.3.5-vtst3.1, 5.3.5-31Mar14
Tegner 5.4.1, 5.3.5
Yambo Beskow 4.0.2

Molecular Dynamics

Program System Available versions
almost Beskow 2.1.0, 2.1
Amber Beskow 14, 12
Tegner 14
GROMACS Beskow 2016.1, 5.1.2, 5.1.1, 5.1, 5.0.6, 5.0.4, 4.6.7
Tegner 2016.1, 5.1.2, 5.0.6, 4.6.7
LAMMPS Beskow 31Mar17, 30Oct14, 10Feb15, 10Aug15
NAMD Beskow 2.10
plumed Beskow 2.3b, 2.2.1, 2.1.2, 2.1.1
Tegner 2.3b

Other Applications

Program System Available versions
Abaqus Tegner 2017, 6.14-6, 6.14, 6.13, 6.12
Caffe Tegner git-c6d93da
cdo Beskow 1.6.7
Tegner 1.7.2
CFITSIO Tegner 3.410, 3.390
Comsol Tegner 5.2a, 5.2.1.262, 5.2, 5.1.0.180, 5.1, 5.0
dock Beskow 6.7, 3.7
dssp Beskow 2.2.1
Tegner 2.2.1
Elmer Beskow trunk_e0d5e66_gnu
Tegner a450ffc-gnu
Elmerice Beskow 5148096_06-17-15-gnu
FDTD Tegner 8.15
geant4 Tegner 10.2, 9.5p01
gensys Tegner 1510
gribex Beskow 000370
KyotoCabinet Tegner 1.2.76
latex Tegner 20150811
MicroMagnum Tegner 0.2rc4
mumax3 Tegner 3.9.1c
NCL Tegner 6.2.1
NCO Beskow 4.4.8
Tegner 4.6.4
oommf Tegner 1.2alpha
papi Tegner 5.4.3
pencilcode Beskow r18525
pflotran Tegner 2014.07.15
pigz Tegner 2.3.3
ROOT Tegner 6.06.00, 5.34.34
Torch Tegner git-7fc533e

Tools

Mathematic

Program System Available versions
gams Tegner 24.7.1, 24.2.2, 23.7.3
mathematica Tegner 11.0.1, 10.2.0
matconvnet Tegner 1.0
matlab Tegner r2017a, r2016b, r2016a, r2015a
MultiNest Tegner 3.10-gcc-5.1-openmpi-1.10, 3.10-gcc-4.8-openmpi-1.8, 3.10-cmake
Octave Tegner 4.2.1
R Beskow 3.1.2
Tegner 3.3.1, 3.2.0
Milner 3.2.2
sage Tegner 7.4, 7.0

Visualization

Program System Available versions
blender Tegner 2.77a
gnuplot Beskow 5.0.0, 4.6.6
grace Beskow 5.1.23
Tegner 5.1.25
Paraview Tegner 5.2.0, 5.0.0, 3.14.1
VisIt Tegner 2.10.0, 2.9.2, 2.8.2
vmd Tegner 1.9.2, 1.9.1

Other Tools

Program System Available versions
allinea-reports Beskow 7.0
Tegner 7.0, 6.1
allinea-forge Beskow 7.0
Tegner 7.0, 6.1
Autoconf Tegner 2.69, 2.64
Automake Tegner 1.15, 1.11
cdo Beskow 1.6.7
Tegner 1.7.2
CMake Beskow 3.7.1, 3.0.2, 2.8.12.2
Tegner 3.5.1, 3.1.3, 2.8.8
Milner 3.6.0
extrae Beskow 3.2.1.gnu, 3.2.1.cray
Git Beskow 2.11.0, 2.2.0
Tegner 2.11.0, 2.3.0
globus-toolkit-client Tegner 6.0
grib_api Beskow 1.12.1-intel, 1.12.1-cray
mercurial Beskow 3.2.2
Tegner 3.4.2
midnightcommander Beskow 4.8.13
mono Beskow 3.12.0
Tegner 3.12.1
nano Beskow 2.3.6
scons Beskow 2.5.1, 2.3.4
Tegner 2.5.1, 2.3.4
tcl Tegner 8.6.4

Compilers and Languages

Program System Available versions
cray Beskow 8.3.4
Milner 8.2.3
gcc Beskow 4.9.1
Tegner 6.2.0, 5.3.0, 5.1, 4.9.2, 4.8.4
intel Beskow 16.0.1.150, 15.0.1, 14.0.4
Tegner 16.0.3, 15.0.2
perl Tegner 5.16
pgi Tegner 15.1
python Beskow 3.6, 2.7
Tegner 3.5, 2.7
upcc Beskow 2.22.0

Libraries

Program System Available versions
beef Beskow 0.1.1
boost Beskow 1.63.0, 1.57.0
Tegner 1.59.0, 1.58.0
Milner 1.61.0
cgns Beskow 3.3.0-gcc, 3.2.1
Tegner 3.3.0-gcc-6.2, 3.2-1
cray-hdf5 Beskow 1.8.14, 1.8.13
cray-libsci Beskow 13.0.1
cray-netcdf Beskow 4.3.3.1, 4.3.2
cray-petsc Beskow 3.5.2.1, 3.5.2.0, 3.5.1.0, 3.4.4.0
CUDA Tegner 8.0, 7.5, 7.0, 6.5
cuDNN Tegner 5.1, 5.0
fftw Beskow 3.3.4.1, 3.3.4.0, 2.1.5.7
Tegner 3.3.4
freesteam Beskow 2.0
Tegner 2.0-gcc-4.8
GLPK Tegner 4.60, 4.50
gmp Tegner 6.1.0
gsl Beskow 2.3, 1.16
Tegner 2.3, 1.16
hdf5 Beskow 1.8.14
Tegner 1.10.0, 1.8.18, 1.8.12
intelmpi Tegner 17.0.1, 5.1.3, 5.0.3
MAGMA Tegner 2.2.0
Mesa Tegner 13.0.2, 10.4.5, 9.2.5
METIS Tegner 5.1.0, 5.0.2
mkl Tegner 17.0.1, 16.0.3, 15.0.2
mpc Tegner 1.0.3
mpfr Tegner 3.1.4
MUMPS Tegner 5.0.0, 4.10.0
NetCDF Tegner 4.4.1.1-gcc-6.2, 4.3.3.1, 4.1.1
OpenCV Tegner 3.2, 3.1
openmpi Tegner 2.0-gcc-6.2, 1.10-gcc-java, 1.10-gcc-5.1, 1.8-gcc-5.1, 1.8-gcc-4.9, 1.8-gcc-4.8
ParMETIS Tegner 4.0.3, 4.0.2
petsc Tegner 3.6.1-real, 3.6.1-complex, 3.6.1, 3.5.4-complex
SCOTCH Tegner 6.0.3, 6.0.0, 5.1.2
slepc Beskow 3.6.3
Tegner 3.6.0-real, 3.6.0-complex
swig Beskow 3.0.10, 3.0.5
Tegner 3.0.10, 3.0.5
tensorflow Tegner 1.1, 1.0
keras Tegner 1.0